Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSME1Q06323 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms