Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN11Q06124 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN11Q06124 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms