Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms