Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBE1Q04446 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms