Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A11Q02978 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A11Q02978 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms