Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms