Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB1Q02641 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms