Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU5F1Q01860 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU5F1Q01860 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms