Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SATB1Q01826 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms