Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE1BQ01064 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms