Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCCQ00597 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms