Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms