Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2C1P98194 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2C1P98194 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms