Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRB1P82279 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRB1P82279 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRB1P82279 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRB1P82279 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRB1P82279 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRB1P82279 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRB1P82279 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CRB1P82279 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRB1P82279 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRB1P82279 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRB1P82279 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRB1P82279 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRB1P82279 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms