Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASIC1P78348 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASIC1P78348 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms