Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM193AP78312 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms