Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK4P57078 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK4P57078 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms