Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX17P56962 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX17P56962 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX17P56962 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX17P56962 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX17P56962 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX17P56962 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
STX17P56962 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STX17P56962 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX17P56962 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX17P56962 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX17P56962 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX17P56962 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX17P56962 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX17P56962 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX17P56962 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX17P56962 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX17P56962 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms