Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLE2P56282 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE2P56282 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE2P56282 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms