Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP7P55210 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP7P55210 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CASP7P55210 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP7P55210 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP7P55210 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP7P55210 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms