Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLTPP55058 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLTPP55058 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLTPP55058 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLTPP55058 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms