Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATN1P54259 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATN1P54259 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATN1P54259 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATN1P54259 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATN1P54259 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATN1P54259 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms