Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BLMP54132 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BLMP54132 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BLMP54132 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BLMP54132 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BLMP54132 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BLMP54132 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BLMP54132 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BLMP54132 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms