Protein–RNA interactions for Protein: P53867

ATG4, Cysteine protease ATG4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG4P53867 ARO1YDR127W 4767 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG4P53867 ROM1YGR070W 3468 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG4P53867 CHS3YBR023C 3498 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG4P53867 SMC3YJL074C 3693 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG4P53867 TAF1YGR274C 3201 nt2.95□□□□□ -1.94
ATG4P53867 RRP5YMR229C 5190 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YPL229WYPL229W 621 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 ATP15YPL271W 189 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 snR191snR191 274 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 TIM12YBR091C 330 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 MAK21YDR060W 3078 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 HFM1YGL251C 3564 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 BMS1YPL217C 3552 nt2.94□□□□□ -1.94
ATG4P53867 BCH1YMR237W 2175 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 TFC1YBR123C 1950 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 PCF11YDR228C 1881 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 NOT5YPR072W 1683 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YFL063WYFL063W 456 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 COX23YHR116W 456 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 RPL26AYLR344W 384 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YOP1YPR028W 543 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 REG1YDR028C 3045 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YNL034WYNL034W 1839 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 TPS2YDR074W 2691 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 SSY1YDR160W 2559 nt2.93□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG4P53867 RPA135YPR010C 3612 nt2.92□□□□□ -1.94
ATG4P53867 TFB1YDR311W 1929 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 RPL30YGL030W 318 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 DLS1YJL065C 504 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 NCE101YJL205C 162 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 PSY1YKL076C 384 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 APC9YLR102C 798 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 snR42snR42 351 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 SSM4YIL030C 3960 nt2.91□□□□□ -1.94
ATG4P53867 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.9□□□□□ -1.94
ATG4P53867 USE1YGL098W 738 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YJL015CYJL015C 285 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 JIP5YPR169W 1479 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 STE6YKL209C 3873 nt2.9□□□□□ -1.95
ATG4P53867 TAO3YIL129C 7131 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 SPO71YDR104C 3738 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 FLO1YAR050W 4614 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YIL058WYIL058W 285 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 GOT1YMR292W 417 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 VPS52YDR484W 1926 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 SIP3YNL257C 3690 nt2.89□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YJL016WYJL016W 1686 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 WIP1YDR374W-A 270 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 CYC7YEL039C 342 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 NUP82YJL061W 2142 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 TMA22YJR014W 597 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 SHH3YMR118C 591 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 SWD3YBR175W 948 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 NPR1YNL183C 2373 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YPK1YKL126W 2043 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 GYP7YDL234C 2241 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 ECM5YMR176W 4236 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 SMC2YFR031C 3513 nt2.88□□□□□ -1.95
ATG4P53867 DOA4YDR069C 2781 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 PRP8YHR165C 7242 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 VPS3YDR495C 3036 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YLR012CYLR012C 300 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 ESF2YNR054C 951 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YTA7YGR270W 4140 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 OSH6YKR003W 1347 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YAT2YER024W 2772 nt2.87□□□□□ -1.95
ATG4P53867 REC8YPR007C 2043 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 MMS1YPR164W 4224 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 NOP4YPL043W 2058 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 RCY1YJL204C 2523 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 GCN1YGL195W 8019 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 DAD4YDR320C-A 219 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 TMA10YLR327C 261 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YBL065WYBL065W 345 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 snR51snR51 107 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 RKM1YPL208W 1752 nt2.86□□□□□ -1.95
ATG4P53867 STE23YLR389C 3084 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YJL181WYJL181W 1836 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG4P53867 APC11YDL008W 498 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG4P53867 YDL041WYDL041W 354 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG4P53867 snR80snR80 171 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG4P53867 MBB1YJL199C 327 nt2.85□□□□□ -1.95
ATG4P53867 UTP30YKR060W 825 nt2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 99.6 ms