Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 COX23YHR116W 456 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF12P53628 BIL1YOR304C-A 231 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF12P53628 RPL20BYOR312C 519 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF12P53628 KAP104YBR017C 2757 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF12P53628 RSN1YMR266W 2862 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF12P53628 SIP3YNL257C 3690 nt2.97□□□□□ -1.93
SNF12P53628 FRE2YKL220C 2136 nt2.96□□□□□ -1.93
SNF12P53628 PSY2YNL201C 2577 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF12P53628 RPL19BYBL027W 570 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF12P53628 AKR1YDR264C 2295 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF12P53628 NPR1YNL183C 2373 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF12P53628 SSY1YDR160W 2559 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF12P53628 LEU3YLR451W 2661 nt2.96□□□□□ -1.94
SNF12P53628 SPO14YKR031C 5052 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 MET6YER091C 2304 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 YER097WYER097W 330 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 YAR053WYAR053W 297 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 YPR014CYPR014C 330 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 MET10YFR030W 3108 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 DNM1YLL001W 2274 nt2.95□□□□□ -1.94
SNF12P53628 snR65snR65 100 nt2.94□□□□□ -1.94
SNF12P53628 APC11YDL008W 498 nt2.94□□□□□ -1.94
SNF12P53628 GCD6YDR211W 2139 nt2.93□□□□□ -1.94
SNF12P53628 FUN30YAL019W 3396 nt2.93□□□□□ -1.94
SNF12P53628 SNQ2YDR011W 4506 nt2.93□□□□□ -1.94
SNF12P53628 snR191snR191 274 nt2.93□□□□□ -1.94
SNF12P53628 TIM12YBR091C 330 nt2.93□□□□□ -1.94
SNF12P53628 RGR1YLR071C 3249 nt2.93□□□□□ -1.94
SNF12P53628 UBP14YBR058C 2346 nt2.92□□□□□ -1.94
SNF12P53628 YLR278CYLR278C 4026 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 YFL032WYFL032W 321 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 URM1YIL008W 300 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 MSL1YIR009W 336 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 TIM8YJR135W-A 264 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 RPL20AYMR242C 519 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 TIM18YOR297C 579 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 ATP3YBR039W 936 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 EGD1YPL037C 474 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 ECM5YMR176W 4236 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 NDD1YOR372C 1665 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 BOI1YBL085W 2943 nt2.91□□□□□ -1.94
SNF12P53628 PRP8YHR165C 7242 nt2.9□□□□□ -1.94
SNF12P53628 BNA4YBL098W 1383 nt2.9□□□□□ -1.94
SNF12P53628 BUD4YJR092W 4344 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 HMRA2YCR096C 360 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 AIM32YML050W 936 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 snR36snR36 182 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 INP52YNL106C 3552 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 NMD2YHR077C 3270 nt2.9□□□□□ -1.95
SNF12P53628 DBP7YKR024C 2229 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 SLH1YGR271W 5904 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YDR102CYDR102C 333 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YGR107WYGR107W 450 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YAR029WYAR029W 225 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 ESF2YNR054C 951 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 COG3YER157W 2406 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YNL034WYNL034W 1839 nt2.89□□□□□ -1.95
SNF12P53628 OST1YJL002C 1431 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 snR8snR8 190 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 BAT1YHR208W 1182 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YJL202CYJL202C 348 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 PRE8YML092C 753 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YPL238CYPL238C 390 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YJL016WYJL016W 1686 nt2.88□□□□□ -1.95
SNF12P53628 COX1Q0045 1605 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 DYN1YKR054C 12279 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 RPS17BYDR447C 411 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 HMF1YER057C 390 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 ROX1YPR065W 1107 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 MSS11YMR164C 2277 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 ATG13YPR185W 2217 nt2.87□□□□□ -1.95
SNF12P53628 HPA3YEL066W 540 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 CAJ1YER048C 1176 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YIL058WYIL058W 285 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 RPL39YJL189W 156 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 FUS1YCL027W 1539 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 PMR1YGL167C 2853 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 CHO2YGR157W 2610 nt2.86□□□□□ -1.95
SNF12P53628 TPS2YDR074W 2691 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 PAU14YIL176C 363 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 PAU1YJL223C 363 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 RPS22BYLR367W 393 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 COX7YMR256C 183 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 RPL9BYNL067W 576 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 PSK2YOL045W 3306 nt2.85□□□□□ -1.95
SNF12P53628 YMR320WYMR320W 306 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF12P53628 PGA1YNL158W 597 nt2.84□□□□□ -1.95
SNF12P53628 IRC23YOR044W 474 nt2.84□□□□□ -1.95
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