Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPAP53621 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPAP53621 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPAP53621 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPAP53621 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COPAP53621 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPAP53621 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPAP53621 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COPAP53621 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COPAP53621 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPAP53621 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPAP53621 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPAP53621 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPAP53621 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COPAP53621 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms