Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PGGT1BP53609 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP53609 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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