Protein–RNA interactions for Protein: P53189

SCW11, Probable family 17 glucosidase SCW11, yeast

Predictions only

Length 542 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW11	P53189	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	RPS27A	YKL156W	249 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SNC2	YOR327C	348 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	OAF1	YAL051W	3144 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	FZO1	YBR179C	2568 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	PUF6	YDR496C	1971 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SRO7	YPR032W	3102 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SSY1	YDR160W	2559 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	EMP24	YGL200C	612 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	GEP4	YHR100C	558 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	AVT1	YJR001W	1809 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	RAD1	YPL022W	3303 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	TFB1	YDR311W	1929 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SSB1	YDL229W	1842 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	APC1	YNL172W	5247 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	IPT1	YDR072C	1584 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	MGR2	YPL098C	342 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SPB1	YCL054W	2526 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	GYP7	YDL234C	2241 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	MNN4	YKL201C	3537 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SCW11	P53189	CDC27	YBL084C	2277 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPL6A	YML073C	531 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPB10	YOR210W	213 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	MIS1	YBR084W	2928 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	GLN4	YOR168W	2430 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	NUP82	YJL061W	2142 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	ABF1	YKL112W	2196 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	APC2	YLR127C	2562 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RBK1	YCR036W	1002 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	ULI1	YFR026C	510 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	MRPL39	YML009C	213 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	SSQ1	YLR369W	1974 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	PDS5	YMR076C	3834 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	SSS1	YDR086C	243 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPL38	YLR325C	237 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	HUL4	YJR036C	2679 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	MUK1	YPL070W	1839 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	VPS54	YDR027C	2670 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	snR79	snR79	84 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YIL165C	YIL165C	360 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YJL022W	YJL022W	309 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPL14A	YKL006W	417 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YPR146C	YPR146C	330 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	NOP53	YPL146C	1368 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	SLP1	YOR154W	1764 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	CWH41	YGL027C	2502 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	PIG1	YLR273C	1947 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	CWC22	YGR278W	1734 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPS18A	YDR450W	441 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	BRP1	YGL007W	378 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPL23A	YBL087C	414 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	RPL33B	YOR234C	324 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	ARK1	YNL020C	1917 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YDR286C	YDR286C	345 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	ERP6	YGL002W	651 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YBR099C	YBR099C	384 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SCW11	P53189	YPK1	YKL126W	2043 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	NCL1	YBL024W	2055 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	DIS3	YOL021C	3006 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YLR255C	YLR255C	354 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	GIS2	YNL255C	462 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	JJJ2	YJL162C	1752 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	SNF2	YOR290C	5112 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	OAF3	YKR064W	2592 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	TRZ1	YKR079C	2517 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	snR62	snR62	100 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YER121W	YER121W	345 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YOL057W	YOL057W	2136 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YDR341C	YDR341C	1824 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	FLO8	YER109C	2400 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SCW11	P53189	YIL059C	YIL059C	366 nt		3.81	□□□□□ -1.8

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