Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPS6KA3P51812 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPS6KA3P51812 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms