Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms