Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF6P49848 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF6P49848 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF6P49848 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF6P49848 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms