Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN2P49810 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN2P49810 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms