Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPAP49450 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPAP49450 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPAP49450 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPAP49450 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms