Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XCR1P46094 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XCR1P46094 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XCR1P46094 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
XCR1P46094 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCR1P46094 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCR1P46094 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCR1P46094 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCR1P46094 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms