Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACADSBP45954 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms