Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA4P43694 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA4P43694 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA4P43694 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GATA4P43694 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA4P43694 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms