Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL35P42766 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms