Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRPPRCP42704 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRPPRCP42704 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms