Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL1P40616 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL1P40616 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL1P40616 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL1P40616 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL1P40616 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL1P40616 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms