Protein–RNA interactions for Protein: P38187

UBP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, yeastyeast

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP13P38187 VPH2YKL119C 648 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 LSM2YBL026W 288 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 RPL20AYMR242C 519 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 TIF11YMR260C 462 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 ISU1YPL135W 498 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 ESC1YMR219W 4977 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 PSK2YOL045W 3306 nt2.8□□□□□ -1.96
UBP13P38187 RLF2YPR018W 1821 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 PDR3YBL005W 2931 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 SNF12YNR023W 1701 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 NEW1YPL226W 3591 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 GIN4YDR507C 3429 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 HYP2YEL034W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 CMS1YLR003C 876 nt2.79□□□□□ -1.96
UBP13P38187 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 YER135CYER135C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 BET3YKR068C 582 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 CMC2YBL059C-A 330 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 snR43snR43 209 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 MMS1YPR164W 4224 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 DUG2YBR281C 2637 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 NUM1YDR150W 8247 nt2.78□□□□□ -1.96
UBP13P38187 RTT10YPL183C 3042 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YDR269CYDR269C 324 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 HPA3YEL066W 540 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 LAG1YHL003C 1236 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 NBL1YHR199C-A 222 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YLR269CYLR269C 351 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YOL159CYOL159C 516 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 PEP12YOR036W 867 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YOR248WYOR248W 303 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 MSS18YPR134W 807 nt2.77□□□□□ -1.97
UBP13P38187 GPI17YDR434W 1605 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YDR250CYDR250C 276 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 TSA2YDR453C 591 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YER079WYER079W 633 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YER189WYER189W 369 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 ESF2YNR054C 951 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YPL197CYPL197C 414 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 NSL1YPL233W 651 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 ACM1YPL267W 630 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 PDR1YGL013C 3207 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 NAB6YML117W 3405 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 BAS1YKR099W 2436 nt2.76□□□□□ -1.97
UBP13P38187 GCV2YMR189W 3105 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP13P38187 UTP14YML093W 2700 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP13P38187 EMC6YLL014W 327 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP13P38187 RPL37AYLR185W 267 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.75□□□□□ -1.97
UBP13P38187 ESL2YKR096W 3588 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 DPB11YJL090C 2295 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 RPS17BYDR447C 411 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 RNR4YGR180C 1038 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YHR138CYHR138C 345 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YJR023CYJR023C 402 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 RPB11YOL005C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 PFF1YBR074W 2931 nt2.74□□□□□ -1.97
UBP13P38187 IRC4YDR540C 540 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 SIP18YMR175W 240 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YOR050CYOR050C 348 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 DGK1YOR311C 873 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 MDM32YOR147W 1869 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 LEU3YLR451W 2661 nt2.73□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 KEL2YGR238C 2649 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YJR079WYJR079W 330 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YOL134CYOL134C 390 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YOR029WYOR029W 336 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 YBR032WYBR032W 303 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 PSD2YGR170W 3417 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 PUF4YGL014W 2667 nt2.72□□□□□ -1.97
UBP13P38187 DNL4YOR005C 2835 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YDR186CYDR186C 2634 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 FIR1YER032W 2631 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 snR76snR76 109 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YGL165CYGL165C 579 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YML084WYML084W 309 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YOR053WYOR053W 342 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 TSC3YBR058C-A 243 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 RNH70YGR276C 1662 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YEF3YLR249W 3135 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 YIL166CYIL166C 1629 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 SAK1YER129W 3429 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 SGM1YJR134C 2124 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 SSN2YDR443C 4263 nt2.71□□□□□ -1.98
UBP13P38187 ADK1YDR226W 669 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP13P38187 TEN1YLR010C 483 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP13P38187 SGS1YMR190C 4344 nt2.7□□□□□ -1.98
UBP13P38187 ROY1YMR258C 1662 nt2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.7 ms