Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLC1P35663 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLC1P35663 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms