Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDIT3P35638 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDIT3P35638 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms