Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NF2P35240 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NF2P35240 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NF2P35240 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF2P35240 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NF2P35240 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms