Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RYKP34925 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RYKP34925 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RYKP34925 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RYKP34925 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RYKP34925 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms