Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCM5P33992 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM5P33992 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms