Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	SSE1	YPL106C	2082 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	AST2	YER101C	1293 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	MTC3	YGL226W	372 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	RPS22B	YLR367W	393 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YOR121C	YOR121C	306 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	BRO1	YPL084W	2535 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	PUF4	YGL014W	2667 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	SSY1	YDR160W	2559 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	PNC1	YGL037C	651 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	RPL40A	YIL148W	387 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	NUP82	YJL061W	2142 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YLR458W	YLR458W	381 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	HFD1	YMR110C	1599 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	ASG1	YIL130W	2895 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	RTT102	YGR275W	474 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YOL159C-A	YOL159C-A	273 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	SAP1	YER047C	2694 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	SNX41	YDR425W	1878 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	UTP14	YML093W	2700 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YPK1	YKL126W	2043 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.65	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YJL181W	YJL181W	1836 nt		2.65	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YJR098C	YJR098C	1971 nt		2.65	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	SIN3	YOL004W	4611 nt		2.65	□□□□□ -1.98
SIP1	P32578	YDL068W	YDL068W	330 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	GPI8	YDR331W	1236 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YJR011C	YJR011C	786 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YBL071C	YBL071C	309 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	TRM7	YBR061C	933 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YPL238C	YPL238C	390 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	LEU3	YLR451W	2661 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	AAD16	YFL057C	459 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YGR035C	YGR035C	351 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	JIP3	YLR331C	378 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	PRE8	YML092C	753 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RGM1	YMR182C	636 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	VPS52	YDR484W	1926 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YJL016W	YJL016W	1686 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SWT1	YOR166C	1377 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YDL041W	YDL041W	354 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YER189W	YER189W	369 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	CGI121	YML036W	546 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YNL146W	YNL146W	303 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	EGD1	YPL037C	474 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	MGR1	YCL044C	1254 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RPA190	YOR341W	4995 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YHR080C	YHR080C	4038 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SAK1	YER129W	3429 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YSW1	YBR148W	1830 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YHR078W	YHR078W	1659 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SHQ1	YIL104C	1524 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SSN2	YDR443C	4263 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	CCW14	YLR390W-A	717 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	COX1	Q0045	1605 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	URM1	YIL008W	300 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RPL40B	YKR094C	387 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	LCL2	YLR104W	396 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	COX7	YMR256C	183 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RPL25	YOL127W	429 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	CDC24	YAL041W	2565 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	NTO1	YPR031W	2247 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	snR76	snR76	109 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YER023C-A	YER023C-A	213 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	TMA22	YJR014W	597 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RAM2	YKL019W	951 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	RNP1	YLL046C	750 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	YPL225W	YPL225W	441 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	ROX1	YPR065W	1107 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SIP1	P32578	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms