Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD11P31277 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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