Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD40LGP29965 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms