Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB2P29033 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB2P29033 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB2P29033 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB2P29033 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB2P29033 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB2P29033 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB2P29033 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB2P29033 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB2P29033 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms