Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms